Análisis de marcadores moleculares para el mapeo comparativo entre leguminosas

Resumen

Este trabajo pretende transferir información desde especies modelo a otras leguminosas y para ello, se han utilizado marcadores desarrollados en M.truncatula y en menor medida en guisante (P.sativum) para su amplificación en habas (V.faba), garbanzos (C.arietinum) y guisante. Los primeros marcadores estudiados han sido microsatélites (ó SSRs) desarrollados en; truncatula. Los resultados mostraron que la transferabilidad entre especies era alta, pero el nivel de polimorfismo escaso por lo que resultaban poco eficientes para estudios de mapeo. Posteriormente se testaron 256 marcadores derivados de fragmentos expresados de genes (ESTs) de P.sativum y M.truncatula, con el objetivo de mapear loci homólogos entre distintas leguminosas. De los 256 marcadores analizados, 221 (86 328%) amplificaron la banda heteróloga en las líneas parentales de V.faba y sólo en 35 parejas de cebadores no obtuvimos ninguna amplificación. Para el genotipado de polimorfismos se emplearon los métodos tradicionales como la identificación ALPs en geles de agarosa o desarrollo de marcadores CAPs. Cuando los métodos descritos no revelaban variación en las secuencias, se pusieron a punto nuevas técnicas que facilitaron la identificación de mutaciones puntuales (SNPs) mediante la enzima Cel l o el desarrollo de marcadores tras SSCPs. Hasta el momento, se han identificado 32 marcadores polimórficos en las poblaciones RILs correspondientes a los dos cruzamientos de habas: Vf6 x Vf136 y Vf29H x Vf136 y de estos se han mapeado 27. Las matrices de sintenia entre V.faba y M.truncatual y V.faba y Pisum obtenidas hasta ahora muestran una clara colinealidad entre V.faba y M.truncatula, mientras que la comparación con P.sativum revela ciertas reorganizaciones cromosómicas. Los resultados del presente estudio, junto con el esfuerzo conjunto de distintos grupos europeos, facilitarán los estudios comparativos entre los mapas de ligamiento de distintas leguminosas.